1.理论基础不同，治疗方案也有不同

中医是以我国特有的阴阳学说为基础，从整体上讲求阴阳平衡，治疗方案首先讲求调理阴阳，也就是人们通常说的“治本”，阴阳学说、五行学说、脏腑学说、经络学说是构成中医理论的基础和要素，中医治疗方案讲求治本为主，标本兼治，而西医是以解剖学和生理学病理学为基础，客观和直观地把人体和病因分析后，针对性地进行治疗。

2.药品主要来源不同

中药基本都是采集的自然界的药材，西药更多的是人工化合物或者天然药的提取物。

3.治疗目标不同

一般中医在治疗过程中还必须考虑身体的不同情况。如果身体的一个内部器官出现问题，它会影响其他内部器官的功能，因此不可能保持身体处于平衡状态。中医是保持身体更好的平衡，也就是调整身体的完整性。当西医发现局部病变时，直接治疗局部病变，无法有效调节身体。

在中医和西医中，没有明确的对与错、好与坏。在临床上，对患者的治疗方法主要根据两种医疗体系的优缺点来判断。每种医疗体系都有其自身的优势，我们需要更好地理解这些差异，中西医结合的研究，正是使两者尽可能地融通。